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尖锐湿疣的病程可以分为三个时期：
潜伏期、亚临床感染和临床感染，每个时期的表现有所不同。潜伏期：HPV病毒可以潜伏3周-8个月，平均约为3个月，没有明显的特征，不易被察觉。如果做组织病理学检查通常不会发现变化，醋酸白试验也无从下手。
亚临床感染：出现容易被忽略或者不易被辨认的损害，诊断时需借助放大镜、醋酸白试验等方法。
临床感染：在下面出现米粒大小的淡红色、淡白色、灰白色的丘疹。随着感染时间的延长，逐渐增大并表面凹凸不平，形成菜花状等赘生物。
